マーク記述混在シートのマークシートだけを使用する事はできますか？

はい、可能です。ただし、シート読み取りする時に、両面印刷された解答用紙でないと読み取りエラーになってしまうため、裏面にもテンプレートを印刷してください。また、採点結果PDFにも裏面の白紙部分が出力されます。